با مصوبه شورای گسترش آموزش عالی رشته های تحصیلات تکمیلی در دانشگاه محقق اردبیلی افزایش یافت
براساس این مصوبه در رشته های 1- شیمی -شیمی تجزیه در مقطع دکتری-2- مهندسی مکانیک -طراحی کاربردی-در مقطع کارشناسی ارشد-3-محاسبات نرم -ساختارهای جبری منطقی در مقطع کارشناسی ارشد-4-مهندسی معماری - در مقطع کارشناسی ارشد برای سالتحصیلی 91-90 دنشجو پذیرش خواهد شد.با افزایش این تعداد رشته، تعداد رشته های این دانشگاه در تحصیلات تکمیلی به 80 رشته رسید که35 رشته آن در دو سال اخیر افزایش یافته است و از این 35 رشته ، 27 رشته در مقطع دکتری در سال 91-90افزایش یافته است .