دانشکده کشاورزی مشگین شهر دانشگاه محقق اردبیلی در نیمسال اول سالتحصیلی ۹۳-۱۳۹۲ با پذیرش دانشجو در سه رشته کارشناسی ناپیوسته مهندسی تولیدات گیاهی-باغبانی ، کارشناسی ناپیوسته مهندسی تولیدات گیاهی- زارعت و کارشناسی ناپیوسته مهندسی تولید و بهره برداری گیاهان دارویی ومعطر آغاز به کار نمود. همچنین از سالتحصیلی ۹۷-۱۳۹۶ در رشته هایکاردانی تکنولوژی تولیدات گیاهی و کاردانی تکنولوژی مرتع و آبخیزداری و از سال تحصیلی ۹۹-۱۳۹۸ نیز در مقطع کارشناسی ناپیوسته رشته مهندسی علوم و صنایع غذایی وکارشناسی ارشدمهندسی علوم باغبانی- گیاهان دارویی به پذیرش دانشجو اقدام نموده است. امید است تا این دانشکده باتوجه به استعداد استان اردبیل و به ویژه شهرستان مشگین شهر در زمینه کشاورزی، گامی در جهت ارتقای کشاورزی منطقه و تعالی ایران اسلامی بردارد.