دانشکده علوم دانشگاه محقق اردبیلی در سال تحصیلی 73-72 با پذیرش 34 نفر دانشجو در رشته فیزیک فعالیت های آموزشی خود را آغاز نمود. این دانشکده در سال تحصیلی 74-73 با پذیرش 31 نفر دانشجو در رشتـه زیست شناسی گرایش عمومی تعداد دانشجویان خود را به 103 نفر رساند و در سال تحصیلی 75-74 با پذیرش 32 نفر دانشجو در رشته ریاضی محض و با ایجاد زمینه مناسب مکاتبات خود را جهت اخذ مجوز برای رسمیت بخشیدن به فعالیت های گروه های آموزشی ریاضی، فیزیک و زیست شناسی تحت عنوان دانشکده علوم آغاز نمود که با همت مسئولین ساعی و تلاش گر دانشگاه در سال 1376 مجوز مربوط به ایجاد دانشکده علوم از طرف شورای گسترش آموزش  عالی صادر گردید.
روند گسترش رشته ها، مقاطع مختلف تحصیلی، فضای آموزشی-پژوهشی، تعداد دانشجویان، کادر علمی-اداری و امکانات و تجهیزات دانشکده به سرعت ادامه یافت به نحوی که هم اکنون دانشکده علوم با فضایی بیش از ده هزار متر مربع  و در دو ساختمان بزرگ ( ساختمان علوم و ساختمان شیخ صفی)، دارای بیش از 38 آزمایشگاه آموزشی و تحقیقاتی، 29 کلاس درس،  دو مرکز رایانه، سه سالن مطالعه دانشجویی و سه آمفی تئاتر بوده و با مجموع بیش از 2247 دانشجو در مقاطع مختلف کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری در قالب 6 گروه آموزشی شیمی، فیزیک، زیست شناسی، زمین شناسی، آمار و علوم کامپیوتر، ریاضیات و کاربردها  با  69 عضو هیأت علمی و بیش از 23 نفر کارمند و کارشناس  فعالیتهای آموزشی و پژوهشی خود را دنبال می کند.  امید است با همت بلند مسئولین دانشکده و دانشگاه، گام های استوار و بلندی در ترقی و تعالی اهداف دانشکده برداشته شده و به ثمر بنشیند.