این پژوهشکده با توجه به ماهیت سنجش سلامتی در چهار حیطه جسمانی، روانی، تربیتی و مشاوره و سازمانی دارای مجوز از هیات امنای دانشگاه محقق اردبیلی بوده و تحت نظارت معاونت پژوهشی دانشگاه و دانشکده علوم تربیتی و روانشناسی دانشگاه در فضای اداری مستقل و با چهار هسته پژوهشی به شرح زیر انجام وظیفه می نماید:

رئیس مرکز: دکتر مهرداد محرم زاده (استاد مدیریت ورزشی)
۱- هسته پژوهشی سلامت جسمانی- رئیس هسته: دکتر فرناز سیفی اسک­شهر (دانشیار فیزیولوژی ورزشی)
۲- هسته پژوهشی سلامت روانی – رئیس هسته: دکتر اکبر عطادخت حاجی سیفلو (استاد روانشناسی)
۳- هسته پژوهشی سلامت تربیتی و مشاوره – رئیس هسته: دکتر حسین تقوی قره بلاغ (دانشیار علوم تربیتی و مشاوره)
۴- هسته پژوهشی سلامت سازمانی – رئیس: دکتر محمد باشکوه اجیرلو (دانشیار مدیریت بازرگانی)