هیأت مدیره نماینده قانونی بنیاد بوده و وظایف آن عبارتند از:

• حفظ و حراست اموال منقول و غیر منقول
•  رسیدگی به حساب ها
•  پرداخت دیون و وصول مطالبات
•  اجرای مصوبات مجامع عمومی
• افتتاح حساب در بانک ها 
•  تعقیب جریانات قضائی و اداری و ثبتی در کلیه مراحل قانونی در محاکم
•  تعیین وکیل و عزل آن
•  قطع و فصل دعاوی از طریق سازش

به طور کلی هیأت مدیره می تواند هر اقدام و معامله ای را که ضروری بداند در مورد نقل و انتقال اموال منقول که مستلزم تصویب در مجمع عمومی می باشد پس از تصویب مجمع به نام بنیاد انجام دهد.

اعضای هیات مدیره :
 

دریف	نام و نام خانوادگی	سمت	تصویر
۱	آقای دکتر اسماعیل چمنی	رییس دانشگاه محقق اردبیلی (عضو اصلی )
۲	حجت الاسلام والمسلمین محمدرضا مصلح نیا	رییس نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاه­های استان اردبیل (عضو اصلی و نایب رئیس)
۳	آقای جواد قرآن نویس	رئیس جامعه خیرین استان اردبیل و رییس مجمع خیرین مدرسه ساز استان (عضو اصلی و رئیس هیأت مدیره)
۴	آقای دکتر معرفت سیاه‌کوهیان	عضو هیأت علمی دانشگاه محقق اردبیلی (عضو اصلی و خزانه دار)
۵	آقای امین فتحی	عضو هیأت علمی گروه معارف دانشگاه (عضو علی البدل)
۶	آقای دکتر عباس فنی اصل	معاون فرهنگی و اجتماعی دانشگاه (عضو علی البدل)
۷	آقای دکتر مهدی داوری	مدیر عامل بنیاد حامیان و عضو هیأت علمی دانشگاه ( عضو اصلی  , مدیر عامل)