1. R.Afroundeh, M.Siahkouhian, A.Khalili. 2010. The effect of post-exercise carbohydrate ingestion on inflammatory responses to short time, high-force eccentric exercise. J SPORTS MED PHYS FITNESS. 50:182-8. 　
2. Roghayyeh Afroundeh; Takuma Arimitsu; Ryo Yamanaka; Chang-shun Lian; Takahiro Yunoki; Tokuo Yano. Effects of humoral factors on ventilation kinetics during recovery after impulse-like exercise. Acta physiologica hungarica 99: 185-193, 2011
3. Roghayyeh Afroundeh; Takuma Arimitsu; Ryo Yamanaka; Chang-shun Lian; Takahiro Yunoki; Tokuo Yano. Effect of arterial carbon dioxide on ventilation during recovery from impulse exercises of various intensities. Acta physiologica hungarica 99: 251-260, 2012
4. Roghayyeh Afroundeh, Takuma Arimitsu, Ryo Yamanaka, Chang-shun Lian, Kazuki Shirakawa, Takahiro Yunoki, Tokuo Yano. Relationship between ventilation and predicted arterial CO2 pressure during recovery from an impulse-like exercise without metabolic acidosis. Physiol. Res. 62: 387-393, 2013
5. Roghayyeh Afroundeh, Takuma Arimitsu, Ryo Yamanaka, Chang-shun Lian, Kazuki Shirakawa, Takahiro Yunoki, Tokuo Yano, Effect of work intensity on time delay in mediation of ventilation by arterial carbon dioxide during recovery from impulse exercise. Physiological Research . 63: 457-463, 2014
6. Roghayyeh Afroundeh, Takuma Arimitsu, Ryo Yamanaka, Chang-shun Lian, Takahiro Yunoki, Tokuo Yano, Kazuki Shirakawa. Arterial CO2 pressure drives ventilation with time delay during recovery from an impulse-like exercise without metabolic acidosis. World Academy of Science, Engineering and Technology. Paris, Issue 71: 1144 -1147, 2012
7. Yunoki T, Arimitsu T, Yamanaka R, Lian CS, Afroundeh R, Matsuura R, Yano T. Ventilatory response to moderate incremental exercise performed 24 h after resistance exercise with concentric and eccentric contractions. Eur J Appl Physiol.111:1769-1775, 2011
8. Yamanaka R, Yunoki T, Arimitsu T, Lian CS, Afroundeh R, Matsyyra R, Yano T. Relationship between effort sense and ventilatory response to intensive exercise performed with reduced muscle glycogen. Eur J Appl Physiol, 112:2149-62, 2012
9. Yano T., Matsuura R., Arimistu T., Yamanaka R., Lian C., Afroundeh R., Kondou S., Yunoki T. Effects of blood lactate On oxygen uptake kinetics during recovery after sprint in humans. Biol. Sport 29:171-176, 2012
10. Yano T, Matsuura R, Arimitsu T, Yamanaka R, Lian CS, Yunoki T, Afroundeh R. Ventilation and blood lactate levels after recovery from single and multiple sprint exercise. Biol Sport 28: 233-237, 2011
11. Arimitsu T, Matsuura R, Yunoki T, Yamanaka R, Kimura T, Lian CS, Afroundeh R, Yano T. Relationship between oxygen uptake and oxygen supply system during constant-load supine exercise. Biol Sport 27: 151-156, 2010
12. Arimitsu T, Matsuura R, Yunoki T, Yamanaka R, Kimura T, Lian CS, Afroundeh R, Yano T. Relationship between oxygen uptake and oxygen supply system during incremental-load supine exercise. Biol Sport 28: 83-88, 2011
13. Yunoki T, Matsuura R, Arimitsu T, Ogata H, Lian CS, Afroundeh R, Yano T. Oscillation induced by dissipative structure in inactive leg muscle is detected in high-intensity arm exercise by near-infrared spectroscopy. World Academy of Science, Engineering and Technology. Lucerne, Issue 70: 863-868, 2012
14. Yano T, Matsuura R, Arimitsu T, Ogata H, Lian CS, Afroundeh R, Yunoki T. Oscillation of oxygenation in inactive arm muscle in ramp leg exercise. World Academy of Science, Engineering and Technology. Lucerne, Issue 70: 863-868, 2012
15. Yano T, Lian CS, Arimitsu T, Yamanaka R, Afroundeh R,　Shirakawa K, Yunoki T. Oscillation of oxygenation in skeletal muscle at rest and in light exercise. Acta Physiol Hug 100:312-320, 2013
16. Yano T, Lian CS, Arimitsu T, Yamanaka R, Afroundeh R,　Shirakawa K, Yunoki T. Comparison of oscillation of oxygenation in skeletal muscle between early and late phases in prolonged exercise. Physiol Res 62: 297-304, 2013
17. Yano T, Lian C-S, Afroundeh R, Shirakawa K, Yunoki T. Comparison of oscillations of skin blood flow and deoxygenation in vastus lateralis in light exercise. Biol Sport 31:15-20, 2014
18. Yano T, Afroundeh R, Yamanaka R, Arimitsu T, Lian C-S, Shirakawa K, Yunoki T. Response of end tidal CO2 pressure to impulse exercise. Acta Physiol Hug. 101(1): 103-11, 2014
19. Yano T, Afroundeh R, Yamanaka R, Arimitsu T, Lian C-S, Shirakawa K, Yunoki T. Oscillation in O2 uptake in impulse exercise. Acta Physiol Hung. 101(2): 143-9. 2014
20. Kazuki Shirakawaa, Takahiro Yunokib, Roghayyeh Afroundeh, Chang-Shun Liana,Ryouta Matsuurad, Yoshinori Ohtsukab, Tokuo Yano. Voluntary breathing increases corticospinal excitability of lower limbmuscle during isometric contraction. Respiratory Physiology & Neurobiology, 217:40-45,2015
21. T Yano, R Afroundeh, K Shirakawa, C-S Lian, K Shibata, Z Xiao, T Yunoki. Oscillation of tissue oxygen index in non-exercising muscle during exercise. Acta Physiol Hug.102: 274-281, 2015
22. Takahiro Yunoki, Ryouta Matsuura, Ryo Yamanaka, Roghayyeh Afroundeh, Chang-shun Lian, Kazuki Shirakawa, Yoshinori Ohtsuka, Tokuo Yano. Relationship between motor corticospinal excitability and ventilatory response during intense exercise. Eur J Appl Physiol. 116(6):1117-26, 2016
23. T. YANO, R. AFROUNDEH, K. SHIRAKAWA, C.-S. LIAN, K. SHIBATA, Z. XIAO,T. YUNOKI. Oscillation in Tissue Oxygen Index during Recovery From Exercise. Physiol. Res. 65: 259-269, 2016
24. Mahdieh Alizadeh, Mohammad reza Asad, Mohammad Faramarzi, Roghayyeh Afroundeh. Effect of eight weeks HIIT exercise on Omentin-1 gene expression and insulin resistant in diabetic male rats. Annals of applied sport science. 2017
25. Saleh, V., Afroundeh, R., Siahkohiyan, M., Asadi, A. Anaerobic Gymnastics Exercises Evoke Systemic Brain-Derived Neurotrophic Factor in Obese and Normal-Weight Children. International Journal of Pediatrics, 2020; 8(12): 12533-12544. 
26.Afroundeh, R., Saleh, V., Siahkouhian, M., & Asadi, A. THE EFFECT OF AN 8-WEEK ANAEROBIC GYMNASTICS TRAINING ON BDNF, VEGF, AND SOME PHYSIOLOGICAL CHARACTERISTICS IN CHILDREN. Science of Gymnastics Journal, 2020, 12(3), 381–394. 
27. Saleh V, Afroundeh R, siahkohiyan M, Asadi A. Effect of anaerobic gymnastics exercise on vascular endothelial growth factor in obese boys. 12Oct.2020 [cited 20Aug.2023];60(6):293-02.
28.Saleh V, Afroundeh R, siahkohiyan M, Asadi A. Comparing the Relationship between Resting Metabolic rate and Body Composition Factors in Obese and Normal Weight Gymnast Children. international journal of pediatrics. 2021; 9(9): 14331-14340
29.Afroundeh, R., Irani, M., Moghaddami, P., Bahram, M. E. The Effects of Static and Dynamic Stretching Exercises’ Order on Some Physical Fitness Factors in Elementary School Children. International Journal of Pediatrics, 2021; 9(9): 14435-14445
30. Afroundeh R, Hofmann P, Esmaeilzadeh S, Narimani M, Pesola AJ. Agreement between heart rate deflection point and maximal lactate steady state in young adults with different body masses. Physiol Int. 2021 Mar 20. doi: 10.1556/2060.2021.00004. Epub ahead of print. PMID: 33764893.
31.  Alikhajeh, Y., Afroundeh, R., Mohammad Rahimi, G. et al. The effects of a 12-week aquatic training intervention on the quality of life of healthy elderly men: a randomized controlled trial. Sport Sci Health 19, 665–670 (2023). 
32. Alijanpour, N.; Nobari, H.; Bolboli, L.; Afroundeh, R.; Garcia-Ramos, A. Using Global Positioning System to Compare Training Monotony and Training Strain of Starters and Non-Starters across of Full-Season in Professional Soccer Players. Sustainability 2022, 14, 3560. 
33. Saleh V, Afroundeh R. Effects of 8-Week Anaerobic Gymnastics Training on Weight Loss and Related Growth Factors in Obese Children: A Clinical Trial. J. Pediatr. Rev 2022; 10 (3) :257-266 

34. آذر آقایاری، رقیه افرونده و پریسا سعیدی آزاد. تاثیر شش هفته تمرین هوازی بر تعادل و انعطاف پذیری زنان سالمند شهر همدان. نشریه سالمندشناسی. شماره 1 دوره 2: ص 9-1. 1395.
35. رقیه افرونده، رعنا سیدزنوزی. بررسی مقایسه تاثیر تمرین اصلاحی سنتی و پیلاتس بر ناهنجاری لوردوز کمری دانشجویان دختر. طب توانبخشی. شماره 6 دوره 6، ص 84-94. 1396
36. عظیمی فرهاد، سیاه کوهیان معرفت، سیفی اسک شهر فرناز، افرونده رقیه. تأثیر چهار هفته تمرین هوازی ویژه بر سطوح CBS و SAM در هیپوکمپ رت‌های مبتلا به بیماری آلزایمر با تزریق Aβ۱-۴۲. مجله دانشگاه علوم پزشكي اراك. ۱۳۹۶; ۲۰ (۱۲) :۵۱-۶۲
37. افرونده رقیه، ایرانی میثم، شاهی میثم. بررسی دقت تخمین فشار CO2 خون شریانی از فشار CO2 انتهای بازدمی در سه شدت تمرینی 30, 50 و 70 درصد حداکثر اکسیژن مصرفی. پژوهشنامه فیزیولوژی ورزشی کاربردی (پژوهشنامه علوم ورزشی)[Internet]. 1398؛15(29 ):183-193. Available from: https://sid.ir/paper/129557/fa
38. عظیمی فرهاد، سیاه کوهیان معرفت، سیفی اسک شهر فرناز، افرونده رقیه. تأثیر چهار هفته تمرین هوازی ویژه بر سطوح CBS و SAM در هیپوکمپ رت‌های مبتلا به بیماری آلزایمر با تزریق Aβ۱-۴۲. مجله دانشگاه علوم پزشكي اراك. ۱۳۹۶; ۲۰ (۱۲) :۵۱-۶۲
39. افرونده رقیه، خواجه لندی مژده، محمدی ربابه. مقایسه اثر ۶ هفته تمرین هوازی بر فعالیت آنزیم کاتالاز و مالون دی آلدئید بافت قلب موش‌های صحرایی نر نژاد ویستار سالم و دیابتی شده با استرپتوزوتوسین: مداخله‌ای (تجربی). مجله مطالعات علوم پزشکی. ۱۳۹۸; ۳۰ (۵) :۳۳۷-۳۴۶
40. حاجی زاده رقیه، افرونده رقیه، پاپی صاد مرضیه. اثربخشی ماساژ بعد از تمرینات ضربه ای بر درد و حس عمقی مچ پا در دختران تکواندوکار مبتدی . بیهوشی و درد. ۱۳۹۸; ۱۰ (۳) :۷۱-۸۰
41. حاجی زاده جبدرق رقیه، افرونده رقیه، سیفی اسکی شهر فرناز. تاثیر ماساژ بر پاسخ آسیب عضلانی, خستگی و درد ناشی از برنامه تمرین تکواندو شامل میت زنی. طب توانبخشی[Internet]. 1399؛9(3 ):39-48. Available from: https://sid.ir/paper/393141/fa
42. افرونده, رقیه, پاپی صاد, مرضیه, سیفی اسکی شهر, فرناز. اثر بی تمرینی بر عوامل آمادگی جسمانی و پاسخ لاکتات خون در دختران نوجوان تکواندوکار. مطالعات کاربردی علوم زیستی در ورزش, 1399; 8(15): 86-97
43. محمدی ربابه، افرونده رقیه، خواجه لندی مژده، محمدیان مهرداد. بررسی اثر حاد تمرین مقاومتی با و بدون محدودیت جریان خون بر شاخص های مرتبط با هایپرتروفی عضلانی. طب توانبخشی[Internet]. 1399؛9(1 ):147-155. Available from: https://sid.ir/paper/239566/fa
44. افرونده رقیه، پوررحیم قورقچی آمنه، فتحی رضا، خوجه لندی مژده، بهرام محمدابراهیم. پاسخ هورمون هپسیدین و متابولیسم آهن به فعالیت مقاومتی دایره ای در مردان تمرین کرده. طب توانبخشی[Internet]. 1400؛10(1 ):124-132. Available from: https://sid.ir/paper/415853/fa
45. ایرانی میثم، افروزنده رقیه، بلبلی لطفعلی، سیفی اسک شهر فرزاد. تاثیر 8 هفته تمرین اینتروال توانی به همراه مصرف عصاره انار بر ترکیب بدن و برخی عوامل موثر بر آن در دانشجویان پسر غیرفعال. (دانش و تندرستی در علوم پایه پزشکی (مجله دانش و تندرستی[Internet]. 1398؛14(4 ):2-11. Available from: https://sid.ir/paper/961674/fa

46. کاردان, شهرام, برغمدی, محسن, افرونده, رقیه, عبداله پور درویشانی, محمد. بررسی اثر خستگی موضعی عضلات چهارسررانی بر طیف فرکانس الکترومایوگرافی عضلات اندام تحتانی در حرکت آبدولیوچاگی در مردان نخبه. پژوهش های فیزیولوژی و مدیریت در ورزش, 1399; 12(3): 123-133.

47. میرزائی, شهناز, سیاهکوهیان, معرفت, افرونده, رقیه, خازنی, علی, انوشیروانی, سجاد. ارتباط پلی مورفیسم ژن ACTN3 با شاخص های قدرت و توان در وزنه برداران نوجوان اردبیلی. پژوهشنامه فیزیولوژی ورزشی کاربردی, 1399; 16(32): 103-114. doi: 10.22080/jaep.2020.19348.1963
48. پوررحیم قورقچی, آمنه, احمدزاده, علی, افرونده, رقیه. اثر 8 هفته تمرین مقاومتی و غوطه وری در آب سرد بر شاخص های آسیب عضلانی و واکنش های التهابی متعاقب فعالیت مقاومتی حاد در بازیکنان فوتسال. مطالعات کاربردی علوم زیستی در ورزش, 1400; 9(17): 32-45. doi: 10.22077/jpsbs.2020.3017.1533

49. محمدی, رها, افرونده, رقیه, خواجه لندی, مژده, قیامی, حامد, بهرام, محمدابراهیم. تأثیر 8 هفته تمرینات یوگا بر شاخص‌های سردرد میگرنی، نیتریک اکساید و سروتونین سرمی در زنان مبتلا به میگرن. پژوهشنامه فیزیولوژی ورزشی کاربردی, 1399; 16(32): 73-86. doi: 10.22080/jaep.2020.19355.1960

50. نبیل‌پور مقصود، آقابابا علیرضا، افرونده رقیه. نگرش ضمنی و آشکار دانشجویان مرد ورزشکار نسبت به مواد ارتقاءدهنده عملکرد. طب پیشگیری. ۱۳۹۹; ۷ (۴) :۵۵-۴۸
51. احمدزاده علی، پوررحیم قورقچی آمنه، افرونده رقیه. اثر هشت هفته مصرف مکمل کورکومین بر شاخص های آسیب عضلانی و واکنش التهابی متعاقب فعالیت قدرتی حاد در بازیکنان مرد فوتسال. فیض[Internet]. 1400؛25(1 ):743-751. Available from: https://sid.ir/paper/407757/fa
52. افرونده رقیه، سیاه کوهیان معرفت، بلبلی لطفعلی، شمسی رضوان. کنترل شیمیایی تهویه ریوی در فعالیت کوتاه مدت منقطع و دوره بازیافت. فیزیولوژی ورزش و فعالیت بدنی[Internet]. 1399؛13(2 ):57-65. Available from: https://sid.ir/paper/956715/fa
53. دلیر افشین، سیفی اسگ شهر فرناز، افرونده رقیه، یزدخواستی انسیه. تأثیر سابقه فعالیت ورزشی بر پاسخ هموگلوبین، فریتین سرم و شمارش گلبول‌های قرمز خون متعاقب یک جلسه فعالیت ورزشی طناب‌زنی شدید. فصلنامه پژوهشی خون. ۱۴۰۰; ۱۸ (۱) :۴۴-۵۱
54. عبدی حبیب، بلبلی لطفعلی، افرونده رقیه، سیاهکوهیان معرفت، خواجه لندی مژده. بررسی تأثیر یک دوره تمرین اینتروال شدید بر سطوح سرمی ویتامین D، تغییرپذیری ضربان قلب و عملکرد ریوی مردان سیگاری: یک مطالعه نیمه تجربی. مجله دانشگاه علوم پزشکی رفسنجان. ۱۴۰۰; ۲۰ (۳) :۲۷۷-۲۹۶
55. پوررحیم قورقچی آمنه، افرونده رقیه. تاثیر تمرین مقاومتی دایره ای بر سطوح سرمی کاردیوتراپین-1 و پلاکت خون در مردان فعال بدنساز: یک مطالعه کارآزمایی بالینی. مجله دانشگاه علوم پزشکی رفسنجان[Internet]. 1399؛19(11 ):1149-1162. Available from: https://sid.ir/paper/963863/fa
56. قیامی تکلیمی حامد، افرونده رقیه، بهرام محمدابراهیم، پوروقار محمد جواد، همتی سهیلا. اثر دوازده هفته تمرینات مقاومتی با کلّ بدن (TRX) بر سطوح سرمی تستوسترون و کورتیزول در مردان سالمند. مجله علوم پزشکی فيض. ۱۴۰۰; ۲۵ (۳) :۹۱۷-۹۲۵
57. هرام محمدابراهیم، افزونده رقیه، قیامی تکلیمی سید حامد، صادقی عباس، غلامحسینی مهسا. تأثیر تمرین تناوبی با شدت بالا و مصرف عصاره‌ برگ لوکوات بر سطوح سرمی آنزیم‌های کبدی مردان چاق مبتلا به کبد چرب غیرالکلی. فصلنامه طب مکمل. ۱۴۰۰; ۱۱ (۲) :۱۰۲-۱۱۵
58. احمدزاده علی، پوررحیم قورقچی آمنه، افرونده رقیه. اثر تعاملی هشت هفته مصرف مکمل کورکومین و تمرین مقاومتی- غوطه ‫وری درآب سرد بر شاخص‌های آسیب عضلانی و واکنش التهابی متعاقب فعالیت قدرتی حاد در مردان فوتسالیست. مجله دانشگاه علوم پزشکی اردبیل ۱۳۹۹; ۲۰ (۴) :۵۵۰-۵۳۳